���򵰰���ѧ������MRM/SMR��PRM����SWATH����

��Դ�� ��������������Ƽ����޹�˾   2019-9-2   ��������1700����(0)

��һƪ�У����ǽ������ǰ��򵰰���ѧ�������������ڣ���������ʶ�°��򵰰���ѧ��������������Щ�أ��Լ�ʲô��SWATH������


���򵰰���ѧ����

�ǰ��򵰰���ѧ�����������������������ĸ����ԣ��ͷ�ȵĶ����ź����ױ��߷�ȵ������ƣ�������Լ��ͷ�ȵĶ��ģ�����ȵ��Ҿ�������ԣ��������ظ���Ҳ�ϵ͡����ŵ�����ѧ�о������룬���쵰����ѧԽ��Խ�ܵ����ǵ����������쵰�׷����ܷ���DZ�ڼ�����־��ӿ��л��ѧ���ٴ�Ӧ�ò��������򵰰���ѧ�������ֱ���ΪĿ�군����ѧ���������������ֲ������ǰ�������ѧ�����IJ��㣬���и�ͨ������׼ȷ�ԡ����ظ��Ե��ŵ㣬�������ڵIJ��쵰����/ת¼��/����������ݣ��ڴ������������У���֤��Щ��־����򵰰���ѧ������Ҫ����MRM/SMR��PRM�����򵰰���ѧ���������������źŴ���ͨ·��⡢������־���о��ͷ���������о����ǻ��ڿ���ĵ��׶��������������һ�ֿ��١���Ч���װ�����������

01 MRM/SRM

���ط�Ӧ��⼼��(multiple reaction monitoring�� MRM���������������ֱ���Ϊѡ��Ӧ��⼼����selected reaction monitoring��SRM�����ü�����������һ�����׵�ɨ��ģʽ������Ŀ�군�׵��ض�ĸ���Ӻ������Ӷԣ�ѡ��ɼ�����Ŀ�����ӹ�����źţ�ȥ�������Ϲ�����źŸ��ţ����и�����ȡ���׼ȷ�Ժ������Եİ��򵰰׶�����MRM���׷�����Ҫ���������׶Σ���1��һ������ɨ��ɸѡ����Ŀ�����������һ�µ�ĸ����;��2����ײ����ĸ���ӣ�ȥ���������ӣ���3��ֻ�ɼ�����ѡ�����������ӵ������źš����Ի�������Ԥ�⣨��MRMpilot���������������ʵ����ѡ��ĸ�����Ӷԡ�

ͼ1. �����ļ��������ǽ���MRMɨ��ʾ��ͼ��

�ü�������޶��ų����������ӵĸ���Ӱ�죬��������˰����Ķε�����ȺͶ�Ŀ���Ķζ��ԺͶ�����������ȺͿ��ظ��ԣ�����Ϊ�ǻ������׼����ĵ��׶�����“���׼”���ر��ʺϽ��б�־���׵ĸ�ͨ����ء�ͨ���������м�����֪������ͬλ�ر���Ķ���Ϊ�ڲΣ�MRM������������Ŀ�군�׵ľ��Զ�����MRM�������ԺͶ��ֶ����������ã�������ѧʵ��ͨ�����������ķ��븻�����裬���Խ������ڱ��ܸ��õĽ���ʵ��������MRM�ʺ϶��������ǣ���߷ֱ��������ǣ�Q-TOF��orbitrap�� FT-ICR��������ppm������������죩�͵ͷֱ����������������ļ��������ǡ�

02 PRM

ƽ�з�Ӧ��⼼����parallel reaction monitoring, PRM����MRM������������Ҳ���ڸ���������Ʒ��ͬʱ�Զ��Ŀ�군�׽�����Ի��߾��Զ�����⡣PRM�ɼ�Ŀ���Ķεĸ߷ֱ���MS2����ͼ��ʹ�������ppm�����Ŀ�����ӽ��з�������ᣬ��Ч�ų��������ӵĸ��š���MRM��ȣ���̬��Χ���㣬���ȸ�������ȸ�ǿ���ظ��Ը��ã�����������������ǿ��ʵ�ʲ������򵥣��ɱ����͡�PRM����ҪԤ�ȸ���Ŀ�군�����ĸ���Ӻ������Ӷԣ�ʵ���˶������ӵ�ȫɨ�衣PRM�����Western blot��������ͨ�����ڴ���������������֤���壬����Ӧ���ڶ��ַ�ģʽ���

PRM��Ҫ�������ʵ�����̣���1����shotgunʵ����߸��������Ʋ�ѡ������ĶΣ���2���Ʊ���Ʒ�Ļ�����3��Ԥʵ����������Ͱ����ĶΣ���4��PRM��⣻��5�����ݷ�����PRM�����IJ���֮���ǵ��������Ķε���������ʱ����Ҫ��ϸ�������ײɼ��������������Ӱ�춨�����ݵ�׼ȷ�;��ȡ�2015�꣬Gallien��ͬ�������һ���ڱ괥��ƽ�з�Ӧ��⼼��(Internal standard triggered-parallel reaction monitoring��IS-PRM)��ͨ������ڱ��ʵʱ�����ɼ�������������Դ�ĶΣ���ʹ�ڷ��������Ķ�����ʱҲ��ʹ���׽��ʼ�ձ��ָ߾�׼״̬��

ͼ2. SRM/MRM��PRM��ʵ�����̶Ա�ͼ��

SWATH/DIA

iTRAQ/TMT��SILAC��label free�ȵ��׶����������ǻ������������Ͳɼ���data-dependent acquisition��DDA������������������ֻ�ܲɼ�һ����ͼ���ź���ǿ��top20������ĸ����ѡ��ʱ������ƫ����ɨ��߷���ĶΡ�SWATH��һ���µ����ײɼ�ģʽ�������������ݷ������ɼ���datain-dependent acquisition, DIA���͸߷ֱ�İ�������������ȡ���ϣ��ܶ�Ŀ�군�׽��м��Ͷ�����SWATH��DIAģʽ�£��ܹ����ض�������Χ�ڵ�����ǰ�����Ӵ��飬�ɼ�������Ƭ���ӣ������γ�����ɨ�����ڵ�ĸ���ӿ���ڵ�������Ƭ���ӣ�����������Ķ���Ϣ��

ͼ3. DDA��DIA��MRM��ԭ��Ƚ�ͼ��DIA������ɼ�ģʽ����

һ��SWATHʵ����ܻ�������ĵ��׶����Ͷ��Խ�������跽���Ż����߷ֱ��ʵ�ģʽ���������������ţ����ѡ������������Ⱥ�ͨ���������ϸ���ṹ��΢���ϸ���������������SWATH�Ķ���Ч���dz��á�SWATH�ɼ�ģʽ����ͬ�� MRM��Ҫ�����ݲɼ�ǰ��Ŀ���Ķ�������������������ֱ�Ӳɼ����ݣ��γɵĵ����ĵ�����������ʱ����ʵ�������ھ�������Ϣ��������ѣ�OpenSWATH24, Skyline25, PeakView���������õ������Spectronaut���͵������ض��ķ����⣬SWATH������ȫ���� MRM �������������߶���ͨ����SWATH��ҪӦ���ڵ������鶨�������׸�����������������׷�����


�Ƽ�����

�����浰����ѧרҵ�Ŷӻ��ڳ��߷ֱ��ʡ�������ȵ�Һ��ɫ��-�������ü���������ϸ������֯����Ʒ�м�������10000�����ף����ȫ�桢��֤��������Ϣѧ�������̣�Ϊ��������ͨ�������ʶ�������ס�

��������

�����ʶ�����ѧ

MMR

SWATH

�������

1. �������׵Ķ�����������ѧ������չ��״[J]. ���\��ͨ��, 2017(9).

2. Rosenberger G , Koh C C , Guo T , et al. A repository of assays to quantify 10,000 human proteins by SWATH-MS[J]. Scientific Data, 2014, 1:140031.

3. ������. mTRAQ/MRM����������AKR��������е�Ӧ��[D]. 2013.

ת���Թ��ںţ���������������Ƽ����޹�˾
​​​​​​​



��������������Ƽ����޹�˾   �̼���ҳ

��ַ���й�������ͨ�����ƴ����߽�9����¥
��ϵ�ˣ�������
�绰��400-008-6094
���棺
Email��info@abace-biology.com